由于创始种群已经灭绝,对现代犬种的起源和极端形态进化的研究很少。在这里,我们分析了8个100-200年前从瑞典北部传统服装中获得的狗毛样本,以探索现代北欧拉普猎犬和麋鹿猎犬品种的起源和人工选择。
本学科组通过与瑞典KTH大学Peter Savolainen教授研究6165com电子游戏开展国际合作,从北欧拉普兰地区博物馆中的八件约100-200年用狗皮制作的大衣、手套等物件中提取aDNA。利用二代测序技术获得全基因组数据后,与全球多个犬种进行基于SNP的系统发育关系分析,证实了北欧多个狐狸型犬种(如,芬兰拉普猎犬、挪威驯鹿犬)均来自于这八件皮张样本所代表的北欧“土狗”。同时,outgroup-f3分析显示它们的祖先最早由欧洲大陆迁徙而来。此外,经过基因交流分析发现这八件皮张样本所代表的北欧“土狗”与欧洲狼普遍存在基因交流。随后,通过选择信号分析发现北欧狐狸型犬种在品种培育的过程中,与耳型相关的MSRB3基因受到了强烈的人工选择,与其犬种标准中定义的直立耳型有着高度的吻合。最后,本学科组通过与云南大学王璐教授研究6165com电子游戏开展合作进行细胞与分子学功能实验,发现了MSRB3基因通过与3‘UTR区域结合的miRNA调控表达,最终影响家犬耳型直立与否的遗传机制。
相关论文“Historic dog furs unravel the origin and artificial selection of modern Nordic Lapphund and Elkhound dog breeds”6月6日发表于Molecular Biology and Evolution。原6165com电子游戏的王识之助理研究员(现单位:云南省畜牧兽医科学院)、云南大学硕士生严雨为并列第一作者,6165com电子游戏的王国栋研究员与瑞典皇家理工学院的Peter Savolainen为论文共同通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金、国家重点研发计划、科技创新-2030、春城计划等项目的支持。
文章链接:Historic dog furs unravel the origin and artificial selection of modern Nordic Lapphund and Elkhound dog breeds - PubMed (nih.gov)
图(A)皮张样本与北欧现代犬种的系统发育关系;(B)北欧现代犬种的遗传起源分析。